Environ 600 experts issus notamment des administrations allemandes, françaises et suisses, se réunissent régulièrement au sein de groupes de travail qui leur permettent d’échanger des informations et de développer des projets concrets dans des domaines variés : agriculture, aménagement du territoire, culture, éducation et formation, entraide en cas de catastrophe, environnement, jeunesse, politique économique, politique des transports, protection du climat, santé, sport, etc.
Le secrétariat commun de la Conférence du Rhin supérieur a son siège à la Villa Rehfus, à Kehl.
Sous l’égide des gouvernements nationaux des trois États membres, la commission intergouvernementale franco-germano-suisse réunit les représentants des ministères des affaires étrangères des États membres. La commission intergouvernementale intervient pour la résolution de questions qui n’ont pas trouvé de solution au niveau local ou régional ou qui exigent le soutien des plus hautes instances des États.